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Caracterização da interação genótipo-ambiente e comparação entre modelos para ajuste do ganho pós-demama de bovinos Devon via normas de reação R. Bras. Zootec.
Corrêa,Marcela Bicca Bragança; Dionello,Nelson José Laurino; Cardoso,Fernando Flores.
Os objetivos com este estudo foram verificar a presença de interação genótipo-ambiente e comparar modelos para o ajuste do ganho pós-desmama padronizado para 345 dias de bovinos da raça Devon, via normas de reação obtidas por regressão aleatória. Foram utilizados 14.973 registros coletados pelo Programa de Melhoramento de Bovinos de Carne entre 1980 e 2005. Para análise dos dados, foi utilizado o programa INTERGEN. Primeiramente, foi rodado o modelo animal convencional (MA), para comparação e estimativas do gradiente ambiental, com base nos desvios dos grupos de contemporâneos, e, em seguida, rodados os modelos hierárquicos de normas de reação com variâncias residuais homogêneas (MHNR) e heterogêneas (MHNRH). Nesses dois últimos, foram incluídos efeitos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Bovinos de corte; Heterogeneidade de variâncias; Inferência bayesiana; Regressão aleatória.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000800010
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Comparação de métodos no ajustamento de curvas de lactação de bovinos por meio de Simulação Ciência e Agrotecnologia
Ferreira,Eric Batista; Bearzoti,Eduardo.
Curvas de lactação representam a produção de leite de uma fêmea leiteira em função do tempo. Uma vez que tais curvas variam aleatoriamente de animal para animal, devido a fatores tanto genéticos quanto ambientais, o modelo misto conhecido como regressão aleatória é apropriado para ajustar os dados de produção de um rebanho. A regressão aleatória foi avaliada neste estudo mediante simulação de dados. Produções de cinco animais em cinco idades foram simuladas em mil conjuntos de dados independentes, em três níveis de precisão, ou seja, a razão entre a variância de regressão e a total igual a 0,9 (variância alta), 0,5 (variância média) e 0,1 (variância baixa) e três graus médios de parentesco entre os animais. A regressão aleatória foi utilizada de duas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Regressão aleatória; Modelos mistos; Curva de lactação.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000400019
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Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite de cabras da raça Alpina R. Bras. Zootec.
Breda,Fernanda Cristina; Albuquerque,Lucia Galvão; Yamaki,Marcos; Reis Filho,João Cruz; Sarmento,José Lindenberg Rocha; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira.
Foram utilizados 9.374 registros semanais de produção de leite de 302 primeiras lactações de cabras da raça Alpina. A produção de leite no dia do controle foi analisada por meio de um modelo animal, unicarater, de regressão aleatória, em que as funções de covariâncias para os componentes genéticos aditivos e de ambiente permanente foram modeladas por meio das funções de Wilmink, Ali e Schaeffer e por polinômios ortogonais, em uma escala de Legendre de ordens cúbica e quíntica. Assumiu-se, ainda, variância residual homogênea durante toda a lactação e heterogênea com três e quatro classes de variância residual. Os modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike (AIC), pelo critério de informação Bayesiano de Schwar (BIC), pela função de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Função de Ali e Schaeffer; Função de Wilmink; Polinômio ortogonal de Legendre; Regressão aleatória.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000200009
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Estimação de parâmetros genéticos utilizando-se a produção de leite no dia do controle em primeiras lactações de vacas da raça Jersey R. Bras. Zootec.
Dionello,Nelson José Laurino; Silva,Carlos Alberto Soares da; Costa,Claudio Napolis; Cobuci,Jaime Araújo.
Registros da produção de leite de 3.531 controles de 620 primíparas da raça Jersey foram utilizados para a estimação dos componentes de covariância e dos parâmetros genéticos para a produção de leite por meio dos modelos de repetibilidade e de regressão aleatória. O modelo de repetibilidade (MR) incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-mês do controle, estação do parto e idade da vaca ao parto como covariável, com termos linear e quadrático, e os efeitos aleatórios de animal, de ambiente permanente e residual. O modelo de regressão aleatória incluiu os mesmos efeitos do MR, com o uso da função de Wilmink para a modelagem dos efeitos fixo (estação de parto) e aleatórios (genético de animal e de ambiente permanente). As estimativas de variância genética...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Bovinos de leite; Componentes de variância; Herdabilidade; Regressão aleatória; Repetibilidade; Seleção.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600010
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Estimativas de parâmetros genéticos para produção de leite e persistência da lactação em vacas Gir, aplicando modelos de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Herrera,Luis Gabriel González; El Faro,Lenira; Albuquerque,Lucia Galvão de; Humberto,Tonhati; Machado,Carlos Henrique Cavallari.
Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para a produção de leite no dia do controle (PLDC), foram usadas as 2.440 primeiras lactações de vacas da raça Gir leiteira, com partos registrados entre 1990 e 2005. As PLDC foram consideradas em dez classes mensais e analisadas por meio de modelo de regressão aleatória (MRA) utilizando-se como efeitos aleatórios o genético-aditivo, o de ambiente permanente e o residual e, como efeitos fixos, o grupo de contemporâneos (GC), a co-variável idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva média de lactação da população. Os efeitos genético-aditivos e de ambiente permanente foram modelados utilizando-se as funções de Wilmink (WIL) e Ali e Schaeffer (AS). As variâncias residuais foram modeladas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Funções de co-variância; Função paramétrica; Parâmetros genéticos; Regressão aleatória.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000900009
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Estruturas de covariância de peso em função da idade de animais Nelore das regiões Sudeste e Centro-Oeste do Brasil Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Valente,B.D.; Silva,M.A.; Silva,L.O.C.; Bergmann,J.A.G.; Pereira,J.C.C.; Fridrich,A.B.; Ferreira,I. C.; Corrêa,G.S.S..
Dados de peso de animais da raça Nelore de 90 a 450 dias de idade das regiões Sudeste (SE) e Centro-Oeste (CO) do Brasil foram utilizados para comparar estruturas de (co)variância de efeitos aleatórios em função de idade estimadas para as duas regiões por meio de modelos de regressão aleatória. Componentes de (co)variância referentes aos coeficientes de regressão aleatória foram estimados por EMREML por meio do programa REMLF90. Os efeitos fixos de grupo contemporâneo e os efeitos aleatórios genético aditivo direto, genético aditivo materno e permanente de ambiente foram modelados por polinômios quadráticos de Legendre. As comparações envolveram estruturas de covariância e de correlação dos efeitos aleatórios, herdabilidades direta e materna e a razão...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de corte; Função de covariância; Regressão aleatória; Trajetória de crescimento.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000200018
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Estruturas de variância residual para estimação de funções de covariância para o peso de bovinos da raça Canchim R. Bras. Zootec.
Toral,Fábio Luiz Buranelo; Alencar,Maurício Mello de; Freitas,Alfredo Ribeiro de.
Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a utilização de diferentes estruturas de variância residual para estimação de funções de covariância para o peso de bovinos da raça Canchim. As funções de covariância foram estimadas pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita em um modelo animal com os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (ano e mês de nascimento e sexo), idade da vaca ao parto como covariável (efeitos linear e quadrático) e da trajetória média de crescimento, enquanto os efeitos aleatórios considerados foram os efeitos genéticos aditivos direto e materno, de ambiente permanente individual e materno e residual. Foram utilizadas diversas estruturas para a variância residual: funções de variâncias de ordem linear até quíntica e 1,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlação; Herdabilidade; Regressão aleatória.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009001100012
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Interação genótipo × ambiente para peso ao ano em bovinos Nelore Mocho no Nordeste do Brasil PAB
Ambrosini,Diego Pagung; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Braccini Neto,José; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Martins Filho,Raimundo; Cardoso,Fernando Flores.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a interação genótipo × ambiente (IGA) quanto ao peso ajustado aos 365 dias de idade, em bovinos da raça Nelore Mocha do Nordeste do Brasil, por meio de modelos de norma de reação, via regressão aleatória com abordagem bayesiana. Os modelos analisados incluíram o efeito fixo de idade da vaca (linear e quadrático) e os efeitos aleatórios genético aditivo e de grupo de contemporâneos. O modelo de norma de reação com variância residual homogênea e um passo (MHNRHO1P) proporcionou melhor ajuste aos dados do que os modelos com variância residual heterogênea e o modelo animal padrão (MA). As estimativas de variância genética (64,41±13,24 kg² a 842,31±58,29 kg²) e herdabilidade (0,11±0,01 a 0,63±0,02) aumentaram com a melhoria...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gradiente ambiental; Inferência bayesiana; Regressão aleatória; Valor genético; Zebuínos.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012001000011
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Interação genótipo x ambiente para peso aos 365 dias em bubalinos da raça Mediterrâneo PAB
Rodrigues,Fernando Barreto; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Ramos,Alcides de Amorim; Ambrosini,Diego Pagung; Malhado,Carlos Henrique Mendes.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi verificar a presença da interação genótipos x ambientes (GxA) para peso aos 365 dias de idade, em bubalinos da raça Mediterrâneo, com o uso de modelos de normas de reação via regressão aleatória. O modelo animal padrão e os modelos de normas de reação foram testados, tendo-se avaliado o modelo hierárquico norma de reação (MNR) com um e com dois passos. O modelo hierárquico homocedástico de norma de reação com um passo (MHNRHO1P) apresentou o melhor ajuste, com base em três critérios de comparação. As estimativas de herdabilidade direta para esse modelo variaram de 0,19 a 0,78, conforme a melhoria do ambiente. Além disso, houve mudança dos valores genéticos diretos (efeito escala) de alguns reprodutores, o que indica a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Efeito escala; Gradiente ambiental; Modelo hierárquico; Normas de reação; Regressão aleatória; Valor genético.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000700615
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Modelos para avaliação genética da produção de leite em múltiplas lactações PAB
Filho,João Cruz Reis; Verneque,Rui da Silva; Torres,Robledo de Almeida; Ribeiro,Virgínia Mara Pereira; Toral,Fabio Luiz Buranelo.
O objetivo deste trabalho foi avaliar componentes de covariância e valores genéticos para produção de leite acumulada em até 305 dias, a partir dos dados das três primeiras lactações de vacas Gir. Foram analisados dados de 14.659 lactações, de 9.079 vacas, por meio dos modelos de repetibilidade, multicaracterístico (Mult) e de regressão aleatória com variância residual homogênea (MRAHo) ou heterogênea (MRAHe). A produção de leite foi considerada como característica distinta em cada lactação, no modelo Mult. Polinômios lineares foram utilizados nos modelos de regressão aleatória para ajuste das trajetórias médias e dos efeitos genético aditivo e de ambiente permanente individuais, de acordo com a ordem de parto. As médias a posteriori da herdabilidade foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Gir leiteiro; Modelo multicaracterístico; Regressão aleatória; Repetibilidade; Seleção precoce..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000400298
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Parâmetros genéticos do peso desde o nascimento até 730 dias de idade na raça Indubrasil PAB
Toral,Fabio Luiz Buranelo; Pereira,Jonas Carlos Campos; Bergmann,José Aurélio Garcia; Josahkian,Luiz Antônio.
O objetivo deste trabalho foi determinar parâmetros genéticos do peso desde o nascimento até 730 dias de idade na raça Indubrasil. Registros de peso (82.481) de 20.890 animais do nascimento aos 730 dias de idade foram utilizados. Os parâmetros genéticos foram determinados por meio de regressão aleatória. Amostras da distribuição a posteriori dos parâmetros de interesse foram obtidas com o amostrador de Gibbs. Polinômios de Legendre ou segmentados foram utilizados para modelar a trajetória média de crescimento. Os efeitos genético aditivo direto e de ambiente permanente direto foram modelados por polinômios de Legendre. Um polinômio segmentado linear-linear, com nó aos 251 dias de idade, ajustou a trajetória média. Polinômios de Legendre quadráticos e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos taurus; Correlação; Herdabilidade; Polinômios de Legendre; Regressão aleatória; Seleção.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014000800595
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Perspectivas de seleção para a resistência à mastite em bovinos da raça holandesa no Brasil. Infoteca-e
COSTA, C. N.; SANTOS, G. G. dos.
bitstream/item/156437/1/Cnpgl-2016-PanLeite83-Perspectivas.pdf
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Melhoramento genético de bovinos; CCS; PDC; Regressão aleatória.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1065202
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Predição de valores genéticos para a produção de leite no dia do controle e para a produção acumulada até 305 dias R. Bras. Zootec.
El Faro,Lenira; Albuquerque,Lucia Galvão de.
Foram estimados valores genéticos para as produções de leite no dia do controle de animais da raça Caracu, usando modelo unicaracterístico padrão (TDMO) e modelo de regressão aleatória (MRA). Os animais foram classificados com base na produção acumulada até 305 (PTA305), como tradicionalmente é feito em gado de leite. Além das produções na semana do controle, o MRA proporcionou predições de valores genéticos para produção até 305 dias, obtidos pela soma dos valores genéticos diários (MRA305). Foram estimadas as correlações de ordem (spearman) entre os valores genéticos estimados pelas diferentes metodologias, observando-se coincidência de touros classificados como deca 1 (10% melhores touros). As curvas de lactação genéticas para os cinco melhores touros...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Função de covariância; Raça Caracu; Regressão aleatória; Produção de leite.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000200017
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Predição simultânea dos efeitos de marcadores moleculares e seleção genômica ampla em cajueiro Rev. Bras. Frutic.
Cavalcanti,José Jaime Vasconcelos; Resende,Marcos Deon Vilela de; Santos,Francisco Herbeth Costa dos; Pinheiro,Cássia Renata.
A seleção genômica ampla (genome wide selection - GWS) foi proposta como uma forma de aumentar a eficiência e acelerar o melhoramento genético, enfatizando a predição simultânea dos efeitos genéticos de grande número de marcadores genéticos de DNA dispersos em todo o genoma de um organismo, de forma a capturar os efeitos de todos os locos e explicar a variação genética de um caráter quantitativo. Objetivou-se com o presente trabalho aplicar o princípio da GWS no melhoramento do cajueiro, estimando simultaneamente os efeitos de 238 marcadores avaliados em 74 indivíduos de uma família de irmãos completos, visando a explicar grande porcentagem da variação genotípica total do caráter peso da amêndoa e a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Seleção assistida; Melhoramento genético; Regressão aleatória; BLUP.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452012000300025
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Regressão via componentes independentes aplicada à seleção genômica para características de carcaça em suínos PAB
Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Silva,Fabyano Fonseca e; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão via componentes independentes (ICR) na estimação de valores genéticos genômicos e dos efeitos de marcadores SNP para características de carcaça de uma população F2 de suínos (Piau x linhagem comercial). Os métodos foram avaliados por meio da concordância entre os valores genéticos preditos e os fenótipos corrigidos, observados por validação cruzada, e também foram comparados com outros métodos geralmente utilizados para os mesmos propósitos, tais como RR-BLUP, PCR e PLS. Os métodos ICR e PCR apresentam resultados similares, mas o método ICR apresenta maiores valores de acurácia.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sus scrofa; BLUP; Marcadores SNP; Regressão aleatória; Redução dimensional.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000600007
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Trajetória de crescimento e efeito da idade da vaca nos modelos de regressão aleatória de bovinos jovens da raça Tabapuã Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Sakaguti,E.S.; Silva,M.A.; Martins,E.N.; Lopes,P.S.; Silva,L.O.C.; Quaas,R.L.; Regazzi,A.J.; Euclydes,R.F.; Duarte,R.G..
Para estabelecer a melhor forma de considerar os efeitos fixos dos modelos de regressão aleatória, avaliou-se a utilização de funções polinomiais na descrição de curvas de crescimento e no efeito da idade da vaca sobre pesos corporais de 41.415 bovinos jovens da raça Tabapuã, criados em regime de pasto. A idade da vaca ao parto e o sexo do animal influenciaram os pesos nos primeiros dois anos de vida, e o efeito da idade da mãe sobre o desenvolvimento dos animais mostrou-se dependente da idade dos filhos. Altos coeficientes de determinação (R²>0,98) foram alcançados utilizando-se o efeito da idade da vaca no dia da pesagem do animal (i.e., a idade da vaca ao parto mais a idade do animal no dia de sua pesagem) em polinômios de, no mínimo, segundo grau, e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de corte; Tabapuã; Curva de crescimento; Idade da vaca; Regressão aleatória.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000400013
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Uso de funções de covariância na descrição do crescimento de bovinos Nelore criados no estado de Pernambuco R. Bras. Zootec.
Santoro,Kleber Régis; Barbosa,Severino Benone Paes; Santos,Eufrázio de Souza; Brasil,Lúcia Helena de Albuquerque.
Este trabalho foi realizado com os objetivos de avaliar diferentes modelos de regressão aleatória, compostos por polinômios de Legendre, utilizados na descrição de efeitos genéticos e ambientais sobre observações do tipo peso-idade e identificar o mais adequado. Analisaram-se dados de peso-idade de bovinos Nelore, nascidos e criados no estado de Pernambuco, com pesagens ao nascimento e em intervalos de, aproximadamente, 90 dias até 720 dias de idade. Foram avaliados seis diferentes modelos de regressão aleatória, com comportamento de graus 3, 4 e 5 para os efeitos genético aditivo direto e de ambiente permanente, e dois tipos de comportamento para os erros (um homogêneo e outro heterogêneo com três classes). Utilizou-se o critério de informação de Akaike...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Critério de informação Akaike; Polinômio de Legendre; Regressão aleatória; Teste de razão de verossimilhança.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000700015
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Uso de modelos de regressão aleatória para descrever a variação genética da produção de leite na raça Holandesa R. Bras. Zootec.
Araújo,Cláudio Vieira de; Torres,Robledo de Almeida; Costa,Claudio Napolis; Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Araújo,Simone Inoe; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Pereira,Carmen Silva; Sarmento,José Lindenberg Rocha.
Registros de produção de leite de 68.523 controles leiteiros de 8.536 vacas da raça Holandesa, com parições nos anos de 1996 a 2001, foram utilizados na comparação entre modelos de regressão aleatória para estimação de componentes de variância. Os registros de controle leiteiro foram analisados como características múltiplas, considerando cada controle uma característica distinta. Os mesmos registros de controle leiteiro foram analisados como dados longitudinais, por meio de modelos de regressão aleatória, que diferiram entre si pela função utilizada para descrever a trajetória da curva de lactação dos animais. As funções utilizadas foram a exponencial de Wilmink, a função de Ali e Schaeffer e os polinômios de Legendre de segundo e quarto graus. A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Regressão aleatória; Produção de leite.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400006
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Utilização de modelos de norma de reação com variância residual heterogênea para estudo de valores genéticos de peso de codornas de corte em função de níveis de proteína bruta na dieta Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Felipe,V.P.S.; Silva,M.A.; Wenceslau,R.R.; Valente,B.D.; Santos,G.G.; Freitas,L.S.; Corrêa,G.S.S.; Corrêa,A.B..
Avaliou-se a sensibilidade dos valores genéticos do peso de codornas de corte, mensurados ao 21º e 35º dias de idade, a dietas contendo diferentes níveis de proteína bruta. Observações obtidas de animais provenientes de duas linhagens (EV1 e EV2) foram utilizadas no ajuste de modelos de regressão aleatória, considerando-se heterogeneidade de variância residual. Os coeficientes de regressão aleatória do intercepto (b0) e linear (b1) apresentaram correlação positiva entre si em todas as análises, porém a linhagem EV2 apresentou maior magnitude dos valores deste parâmetro para ambas as idades. Houve heterogeneidade de variância genética aditiva e alteração na herdabilidade com a mudança no nível proteico da dieta para ambos os grupos genéticos e em todas as...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Interação genótipo-ambiente; Regressão aleatória; Avaliação genética; Codornas de corte.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352012000400028
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